企业采访| 盛世君联:将AI与生物医药结合,创建大分子AI药物研发平台

12/28/2023 药物研发曾晞

随着 ChatGPT 的诞生,人工智能(AI)赛道迎来新一轮技术革新高潮,而在此之前,国内有公司早已提前布局,蓄势待发。

今年 10 月, 成都盛世君联生物技术有限公司 (以下简称“盛世君联”)宣布由其创建的基于生物学逻辑的 ABLINK BioAI 药物研发系统正式上线 —— 这是 AI 技术在生物医药领域的又一次尝试

AI 如何与生物药领域进行结合?盛世君联与市场上已推出的 AI 模型有何差别?

近日,记者走进了位于成都天府生命科技园区的“盛世君联”,并采访了公司首席技术官曾昕博士,毕业于清华大学的她,主攻结构生物学研究,她向记者讲述了公司如何攻破 AI 药物研发的技术高壁垒,以及技术研发团队背后的故事

# 从真实药物库到 BioAI 驱动的生物药物研发

盛世君联于 2016 年成立,是一家依托全球领先的生物药物库技术和生物学人工智能(BioAI),专注于大分子药物发现和优化的高新技术公司

公司成立以来,经过 2 次重要的本地技术突破,一是“多位点突变效率从最初的 20%提高到 100%”,二是“单次构建 10 11 多样性合成库”,形成了公司核心技术壁垒之一——“全合成库技术”,并建成了三千亿级多样性真实生物药物库。这为后来做 AI 模型训练多种数据来源打下了基础。

“2021 年,随着我们深入探究 AI 的发展和应用,我们认识到 AI 的前景很宏大,坚信 AI 能够在生物药研发上大有所为,解决领域内现有的很多痛点,于是我们开始搭建 AI 团队。”

同时曾昕也认为,AI 还可以弥补大小公司中间的差距。因为 AI 模型在生物药物专业领域的深度应用不同于时下热门的大模型开发,并不一定需要巨大的财力投入去重复造轮子,反而对于 AI 模型的训练,时间和数据的持续积累“小步快跑”更加重要。这对于成本、资源不占优势的小公司来说是一个难得的机会。

曾昕谈到,2021 年到 2022 年,公司利用自有三千亿级多样性真实生物药物库,在不断积累海量真实、高质量数据的同时,也在探索、加深对 AI 的理解。一边积极接触和使用最新的 AI 工具成果,一边尝试与国内多家头部的 AI 医药企业去碰撞、合作。

# AI+生物医药 打破跨语言沟通困局

谈到 AI+生物医药,曾昕认为,“尽管很多公司都希望能够尽快推出自己的 AI 模型占据市场头部地位,但是真正要想研发出能够真正应用于生物药研发相的模型其实是需要时间、数据的积累的,这里存在速度与效率取舍的问题。我们不会刻意追求速度,而是会在不断持续投入的同时,保持敏锐的观察力,及时调头纠错。”

现在国内外都已经有不少优秀大模型,但如何能够将其应用于生物医药领域?在公开数据相对较少、数据验证反馈较慢的大分子药物研发方面,该如何训练和使用 AI 呢?

AI 与大分子药物研发结合障碍很多,最关键的一点即:技术语言沟通问题。 算法模型开发者与生物药物研发者之间存在着认知、语言、理解和路径逻辑上的差异,无法进行有效交流。

在 AI 与生物学的链接上,作为公司 CTO,曾昕起到了关键的桥梁沟通作用。“我会用结构生物学的思维去像指导真实实验一样指导怎样应用 AI,做好 AI 研发控制点,避免走急于追风的弯路歪路,比如在前 AI 时代我们用结构生物学给某些工序的人工设计纠错,AI 时代就可以上到更大的通量直接取代人工设计。应该说我们这两年都是这个思路,利用我们的知识背景,去找我们最趁手、最符合生物学逻辑的工具,然后把它用到最大化。”

经过 3 年的技术沉淀和大量自有真实数据验证,盛世君联的这款大分子 AI 药物研发系统 “ABLINKBioAI”正式上线,即“BioAI for Scientists”。它是依托盛世君联自有“三千亿级真实生物药物库和以生物学为逻辑的人工智能(BioAI)搭建而成,是包括真实数据生产、AbCypher 数据处理、BioAI 算法、AI 软件、高通量真实验证的闭环式、干湿轮转、自动迭代的 AI 生物药物研发系统。

# AI 加持生物医药 研发效率提升 30 倍+

这个系统如何帮助科研工作者解决研发问题?

据了解,公司称这个系统为一键输入、一键输出“傻瓜式”应用系统。

过去,盛世君联传统服务客户的方式是定制式服务:从客户提出具体要求,到公司最后交付,这个过程短则 2-3 个月,长则半年。

而现在,对于客户的不同要求, 通过运用 ABLINK BioAI 系统中相应服务类型,提交数据后,即可等待 AI 结果。“相当于把实验的东西大部分用 AI 去替代。不仅提高了效率,还降低了研发成本。”曾昕介绍。

从时效上来说,过去传统的交付周期为 8-12 周的,现在缩短为只需 1 周,甚至只需几个小时,平均足足缩短了 30 倍时间。不仅在效率上有了极大的提高,而且准确度也是能够保证的。

这个研发系统已于今年 10 月份正式上线,公司近期推出了免费测试,参与者可以免费注册、测试。目前,已有多家公司申请了免费试用,并陆续拿到交付结果。现在已经有客户开始和公司以正式商业服务形式合作。

# 上榜四川“专精特新”中小企业 希望讲好更多技术创新故事

如今,专精特新企业已成为各界关注的焦点。

2022 年,盛世君联上榜了四川省经济和信息化厅认定的四川省“专精特新”中小企业名单, “专精特新”特指具有“专业化、精细化、特色化、 新颖化”特征的中小企业,他们都是自己所在细分领域的佼佼者。

公司新增了一项“硬科技”技术,未来是如何规划的?

曾昕介绍到:“AI 的强大是真风口,但深入应用研究才能站稳脚跟,我们要乘风而非跟风。我们认为目前公司走的大方向是对的,现在我们地基已经打好了,需要做的是修大厦过程中一步一步踏实去垒砖。”

根据公司战略,公司未来将“两条腿”走路。因为公司优势还是在生物医药本身,所以首先还是将 ABLINK BioAI 不断迭代更新,去逐步替代更多传统人工研发环节,提高药物研发效率;同时也会不断将我们的优势拓展外延,使 AI 嵌入到更多的应用场景。

ChatGPT 的爆火,生成式人工智能(AIGC)成为绝对的市场热点,国内外各大厂商纷纷入局,生物医药领域也不例外。

然而在曾昕看来,目前 AI 市场还是偏喧嚣、浮躁的。很多同行在急于推出产品后没有持续投入维护,导致技术在达到真正实用以前就停滞;或走了错误的方向沉没成本太大而转型困难。AI 对行业的改变不会是颠覆式的,而是会如细水长流一样,慢慢浸润。”

对于盛世君联自研生物学人工智能(BioAI)这个系统,尽管已经经过大量的严谨的实验数据验证,可提供准确的实验结果,但公司仍然在不断迭代更新系统,追求 AI 更高置信度、更多的应用场景。盛世君联的最终愿景是,希望能以更高置信度的 AI 技术服务更多医药工作者

成都盛世君联生物技术有限公司(ABlink Biotech)成立于 2016 年 3 月,是一家以领先的全合成库技术为基础的技术型公司,专注于大分子药物发现和优化。公司位于我国西部重要的生物产业孵化中心——成都市天府生命科技园,是该园区重点培育的创新创业型企业之一。

抗体库技术作为单克隆抗体发现的主流技术,是当前中国药物创新中具有至关重要的地位。一个理想的抗体库必须同时具备库容多样性两个核心元素。从创立初期起,ABlink Biotech 致力于构建自主知识产权的药物库。经过两次技术突破,公司已成功构建出真实抗体库,并达到了**“三千亿级多样性”**的水平。

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