NGS辅助的高亲和力抗体筛选(AI数据挖掘)

1/2/2024 抗体筛选BioAI

# 背景:

第二代(NGS,next-generation sequencing)测序,又称为高通量测序技术,相对于传统的一代测序技术测序(Sanger sequencing)而言,NGS 测序技术能够一次能对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定。NGS 测序技术的发展和成熟,使得分析抗体基因序列,特别是针对大容量、多样性高的抗体基因库序列的系统分析成为可能。目前用于基因库筛选的所有展示技术均采用了一种表型选择压力的原理,即依赖于受体-配体的竞争结合力,这样的筛选过程一方面通过展示技术富集了目标抗体基因,另一方面可能导致筛选环节中的一些稀有分子、低结合力分子、可溶性表达量过低的分子或产量较低的抗体基因被漏筛。而 DNA 测序过程没有选择压力,可以释放较完整的基因库的序列信息,有利于捕获目标基因。

# 服务流程:

利用其的高通量性,NGS 测序能够获取在经过 3-5 个筛选周期筛出的数万个阳性单克隆抗体的基因序列,对于这些序列的生物信息学分析将它们依据在 CDR 区域的不同进行分组,并在每一组中挑选一至二个克隆进行表达验证,根据验证结果和实际需求选择合适的组并对组内其他序列进行表达验证。对于筛选出的目标力抗体,获得其编码序列后能以重组蛋白的方式来稳定获得抗体。

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